Para la gestión de estos usos y espacios se ha planteado un sistema de funcionamiento que ha de garantizar el mantenimiento del proyecto con la participación de todos los miembros, cada uno según sus posibilidades y voluntades, y procurar la creación de riqueza colectiva según las necesidades del proyecto y de los aliens. Esto tiene que ser de una manera horizontal, transparente y crítica, con tal de fomentar sistemas de relaciones humanas con estas características.

El elemento del juego relativo al funcionamiento del proyecto es la propia Nautarkia, un sistema de 'govierno de los navegantes' entendiendo como navegantes los diferentes participantes puntuales o habituales del proyecto. La Nautarkia se define para constituir diferentes galaxias temáticas y constelacions transversales, que son entendidas como grupos de trabajo, unos temáticos y los otros funcionales. Estas perfilarán el organigrama colectivo, donde las decisiones comunes están mediadas por grupos concretos, pero donde participan todos los otros. Con este organigrama se pretende poder distribuir todas las responsabilidades, a diferentes niveles, entre los aliens participantes.También garantizar una diversidad en las diferentes temáticas y acciones durante el proceso del proyecto.

Galaxias

Constelaciones

También hay 9, cada una de ellas relacionada con una Galaxia temática y un aspecto importante i común del proyecto. Tanto a nivel de mantenimiento com de desarrollo. Están constituidas por todos los miembros que lo deseen de la galaxia tematica con la que se relaciona, i por un miembro de cada otra galaxia tematica. Es decir, un mínimo de 9 aliens. Uno de estos, será quien hará las tareas de coordinación y comunicación de la constelación, ésta tiene que ser bastante clara y relacionada con una persona concreta.

Las constelaciones transversales pueden plantear actividades a nivel interno y/o a todas las galaxias. Así se pueden realizar acciones colectivas de mantenimiento y desarrollo, una por trimestre, con tal de poder facilitar el conocimiento y configuración de las propuestas. Así mismo, las constelaciones pueden pautar las tareas a realizar dentro de las otras actividades en relación a sus ámbitos respectivos.

Estas constelaciones tienen un papel relevante dentro de la fase de preparación con tal de fomentar la coordinación galáctica i ofrecer pautas de úso para los distintos escenarios del juego. Al mismo tiempo tendrán diferentes papeles durante la fase de ejecución y especialmente en la de conclusión donde desaparecen, en cierta manera, las galaxias temáticas (ya que no habrá actividades programadas).